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首页 > 拜谱生物 > 市场活动 > 新款上市正式发布|乳碱化的学渣逆袭小哥,衣康碱化表达蛋白酶组嚣张来临!

新品发布|乳酸化的逆袭兄弟,衣康酸化修饰蛋白组强势来袭!

发布时间:2025-01-20

一只做为医药化工物理原料而被掌握的衣康酸(Itaconate,ITA),与乳酸从“分解代谢废品”拥有“宝物小大分子”的艰辛心路历程相类似,甚至近几十年才被挖掘其根本的生理学学的功能,从“平躺农奴把大合唱”,尤其是在免疫检测细菌感染性疫情钻研方向内异军突起。以有几篇参考文献有关报道了在各项细菌感染性疫情的哺乳动物模式化中提供给衣康酸或其物理遮盖衍化理学的制疗益处,并挖掘其潜在的靶点。关于幼儿园衣康酸的“上辈子”与“这辈子”,具体情况见微信推文《乳酸的奋斗史弟兄——衣康酸!这课教你了解一下衣康酸》。

拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康酸性反应修饰语核蛋白组学产品,实现1000+玄之又玄度绘制位点检测出,平衡显现经曲靶点,全地方生信分析一下解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“感觉”到“检验”全方案工作,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。

PART 1

01、试验步奏

02、场地实测动态数据

03、经“点”重演

在测试数据源数据源中,查出个论文参考文献中报道怎么写的传统靶点十分衣康酸掩盖位点,如第1个被感觉的衣康酸共价掩盖血清KEAP1,和糖酵解通道中的3个主要酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,和炎性小体组成了血清NLRP3和細胞萎缩环节中的主要血清RIPK3等,其质谱图下述图随时。

04、企业产品作用

1.多方面质控

行业化活性聊天探头孵育、SDS-PAGE检查测量、WB验正、样本量相应的性剖析等各个位检查测量,提高认识大型项目报告单靠得住性。

2.高功率指标质谱检测设备手机平台

在Orbitrap Astral全新新一批高分辩质谱仪加持咒下,实行衣康碱化绘制位点及蛋白酶鉴定结论新层次,注力科学性深入分析新出现。

3.全方法一坐式服务管理

应用于拜谱生物体加强制度建设的调查游戏平台,可出具“癌细胞培养计划→探头孵育→WB测试→高妙度衣康酸性反应体现测试→炫舞心悦生信分折→相应位点PRM认证”全步骤流程业务,省时杠杆原理更好些。

05、剖析内部(这部分)

06、app方向盘

PART 2、期刊论文分亨

论文资料一

英文版主题:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)

中文名主题:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析

实验游戏内容:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。

(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)

医学文献二

英文字母名称:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)

中文名副标题:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性

探究网站内容:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。

(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)

PART 3、真实案例具象化设想

蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13有较为强烈的底物结合在一起作用,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。

S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。

(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)

值得一提的是,在拜谱生物技术衣康碱化掩盖组实测值数据统计中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康酸性反应淡化(一下图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。

PART 4、拜谱总结

算作TCA配置中的间消化吸收转化物,衣康酸调消化吸收转化、抗体和支原体感染之中的相互间用,为方法抗体支原体感染性皮肤疾患提拱了替代品方法原则。衣康酸节构中的亲电性α,β-不饱和羧酸节构能对淀粉酶质上的渗透性半胱氨酸残基确定烷基化淡化语语(迈克尔增加不良反应),此种翻譯后淡化语语被叫做“衣康酸淡化语语(itaconation)”,必将不良影响淀粉酶质功能键,自我调节抗体回复和消化吸收转化有效途径,为三种皮肤疾患食用的药物生产制造提拱新理念。

拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康碱化呈现蛋清组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物医美任何时候按量靶点排泄组(QMT1000)或能量场分解靶点分解组车辆对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!

基准期刊论文

1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.
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