
拜谱生物全新推出免疫肽组拜谱生物,通过MHC抗体阳性聚集MHC举例说明运用肽,使用Orbitrap Astral全新一代高分辨质谱仪检测,直接得到免疫抗体肽编码序列并且当地翻译后呈现信息内容,提高基因测序的真实度,并采用De novo重头测序技术工艺,不依赖现有数据库,更好通量鉴定出MHC上呈递的多肽,发现更多非典型免疫肽,而且丰富的的统计资料讲解信息为医学研究中的新抗原鉴定、免疫治疗和疫苗开发提供支持。欢迎大家咨询!
图1 MHC-I和MHC-II呈递恶性肿瘤抗原的经由
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案例分享浅析
01 原则探讨
优秀文章题目大全:The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells
公布杂志网站:Science Advances IF:11.7 2024
XPO1 (Exportin-1/CRM1)一种核打印输出蛋白质,在肉瘤中通常过展现,并且做好为肉瘤时有发生的驱动下载原则。到目前为止,靶向疗法XPO1的小原子正被用在临床医学治疗癌症药物剂量。作者发现XPO1是自然杀伤(NK)细胞的靶标。利用免疫抗体肽组学,作者鉴定出一种衍生自XPO1的肽,它可以在人类白细胞抗原- C的背景下被激活的NK细胞受体KIR2DS2识别。该肽可以内源性加工并通过该受体特异性地激活NK细胞。虽然XPO1在癌症中的高表达通常与不良预后相关,但研究发现,如果有NK细胞浸润的证据,特异性癌症(如肝细胞癌)的预后可以大大改善。因此,作者确定XPO1是NK细胞识别的真正的肿瘤抗原,为NK细胞治疗实体瘤的个性化方法提供了机会。
图2 一些来于XPO1的肽是KIR2DS2的配体
02 肿癌-免疫检测疗法
一篇文章考题:Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors
刊出异物:Nature Communications IF:16.6 2023
梭形体细胞肺部肿瘤胸膜间皮瘤(MPM)是种生存率不良现象的侵蚀性肺部肿瘤。可能现今的改善方案怎么写或缺见效,对此急迫需新的改善方法。综上所述其T体细胞侵润性,笔者有效市场理论MPM是个适用的改善性癌证预防针的关键。迄今为止,对间皮瘤的研究一直集中在识别分子标记以更好地对该疾病进行分类和表征,对涉及细胞毒性(CD8+) T细胞的治疗靶点知之甚少。在这项研究中,作者利用因为质谱的天然免疫肽组研究了小鼠(AB12细胞系)和人细胞系(H28、MSTO-211H、H2452和JL1)以及患者原发性肿瘤中MPM的抗原呈递景观。作者使用来自人类健康供体和癌症患者的T细胞体外表征了洗脱肽的免疫原性特征。此外,作者选择最有前景的肽搭配PeptiCRAd方法,在雌性小鼠的间皮瘤小鼠模型中测试其疗效。总的来说,作者证明了免疫肽组学分析与溶瘤免疫疗法相结合的使用代表了一种解决不可治疗肿瘤的可行且有效的策略。
图3 恶性肿瘤胸膜间皮瘤抗体肽组学的检测
03 杆菌mRNA狂犬疫苗设计规划
一篇文章问题:Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes
发表过刊物:Nature Communications IF:16.6 2023
单核细胞增生李斯特菌是一种导致人类李斯特菌病的食源性细胞内细菌病原体。尽管死亡率高且抗生素耐药性增加,但仍没有临床批准的针对李斯特菌的疫苗可用。为了鉴定新的抗原,作者通过为质谱的免疫力肽组学来筛选呈现在受感染的人类细胞系表面的李斯特菌肽。在超过15000种人类自身肽中,作者检测到来自42种不同细菌蛋白的68种李斯特菌免疫肽,包括几种已知抗原。呈现在不同细胞系上的肽通常来自相同的细菌表面蛋白,将这些抗原归类为潜在的候选疫苗。在脂质纳米粒mRNA疫苗制剂中编码这些高度呈递的抗原导致特异性CD8+ T细胞应答,并在小鼠的疫苗接种攻击实验中诱导保护。研究结果可以作为开发针对李斯特菌的临床mRNA疫苗的起点,证明了基于质谱的免疫肽组学在下一代细菌疫苗开发中的作用。
图4 在李斯特菌妇科感染的Hela神经元和HCT-116神经元中评定MHC I呈递的抗原肽。
拜谱个人总结
免役肽组学是蛋清质组学的其中一个高速发展前景的分支节点,它专注力于研究探讨免役设计中由注意组建化相融性包覆体(MHC)或人类白组建肿瘤细胞核核系抗原(HLA)团伙呈递的免役肽。这个免役肽是组建肿瘤细胞核核系外壁呈递的肽段,能被T组建肿瘤细胞核核系识别图片,以此引发免役生理特点反应。立于质谱的免役肽组学早已经形成签定MHC蛋清呈递肽的金要求手段,能直接的签定有差异生理特点和病症壮态下有差异组建化和组建肿瘤细胞核核系分类中的免役肽组,譬如实物瘤或病毒是什么感染支原体的组建肿瘤细胞核核系。拜谱生物作为国内领先的多组学公司,可提供完善成熟的蛋清组学、代谢转化组学、转录组学等多组学产品技术服务体系。全新推出的免役肽组的测试服务于,通过MHC抗体特异性富集,高分辨质谱检测结合De novo从头测序技术,还可以更准且会作为天然免疫检测肽字段,出现 更加多非主要表现天然免疫检测肽,自上而下需求出可以信赖新抗原,有助于医学研究人员理解免疫系统的机制、开发疫苗、个性化癌症免疫疗法以及深入了解各种疾病的发病机制。
参看期刊论文
1. Xie N,Shen G,Gao W, et al. Neoantigens: promising targets for cancer therapy. Signal Transduct Target Ther. 2023;8 (1):9. doi:10.1038/s41392-022-01270-x 2. Blunt MD,Fisher H,Schittenhelm RB, et al. The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells. Sci Adv. 2024;10 (34):eado6566. doi:10.1126/sciadv.ado6566 3. Chiaro J,Antignani G,Feola S, et al. Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors. Nat Commun. 2023;14 (1):7056. doi:10.1038/s41467-023-42668-7 4. Mayer RL,Verbeke R,Asselman C, et al. Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes. Nat Commun. 2022;13 (1):6075. doi:10.1038/s41467-022-33721-y