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首页 > 拜谱生物 > 干货分享 > 在线药学学阐释草酸钙肾结石硫化应激反应和细菌感染磨损规则

网络药理学揭示草酸钙肾结石氧化应激和炎症损伤机制

发布时间:2024-08-02
草酸钙(CaOx)肾结石是泌尿机设备通熟悉的病毒的一种。肾机构中CaOx晶胞过饱和火成岩会存在肾小管上皮细胞断裂和凋亡,最终得以存在肾结石的演变成。短链多余多余脂肪酸由胃肠内厌氧发效日常细菌发效伙食合成纤维存在,除了在部分胃肠天然屏障中起意义,还在机设备能力上也起重要的意义。各举,丁酸是最非常丰富的短链多余多余脂肪酸,存在消除炎症和抗体遏制意义,本研究方案论述丁酸对CaOx肾结石的意义简答存在靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究,华山醫院泌尿整形外科吴忠教学、周子健博士后于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果,7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠专家、周子健博士生在Food and Chemical Toxicology(IF=4.3)上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤,并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因,最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱生态学与吴忠教授、周子健博士团队再次合作,提供了网站临床药理学服务的,助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点,为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

内容称呼:Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9(Food Chem Toxicol.,IF=4.3,2023.07) 潜在客户组织:华山诊所 探究另一半:大鼠、HK-2細胞 分成小组信心:比组(Con)、模板组(Model)和丁酸钠组(NaB) 拜谱给出技术水平:互联网药理学学检查测量

难点操作流程图模板

实验结果显示

论述人群先搭建大鼠模形,能够生理上生物化指标图和组织开展方面的问题学上色等论述机制表明丁酸会减低CaOx模形大鼠肾CaOx晶胞的形成了和直接破损,有所改善CaOx模形大鼠的发炎直接破损和防氧化的杂质的过于呈现。不仅如此,丁酸还可抑止草酸诱骗的HK-2人体細胞直接破损、防氧化的应激反应和人体細胞凋亡。 为研发丁酸构造和靶人类人类DNA组遗传互联网信息,研发人从PubChem得到 丁酸和丁酸酯的二维和三维图像构造(图1A)。采用PharmMapper的同时在线和Uniprot的同时在线治理 后共选择出113个丁酸靶人类人类DNA组遗传供进那步研究。将人类人类DNA组遗传全部引入STRING的同时在线,参与进来PPI互联网信息研究。Cytoscape列出了排列顺序的前20的核心区靶人类人类DNA组遗传的详细反映互联网信息图,、CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2(图1B)。这类核心区人类人类DNA组遗传与互联网信息中的的人类人类DNA组遗传均核心表现出固定的一些性,反映这类人类人类DNA组遗传机会切实起着着协同工作效用。GO和KEGG研究证明了丁酸核心区人类人类DNA组遗传的一些方式和海洋物理学功能性(图1C)。核心区人类人类DNA组遗传核心与类固醇雌激素药对答、腐蚀物应激性状态对答、抗逆性氧神经元对类固醇雌激素药促使的意义、对强酸有机化学的物质的意义相关。综合上面的所诉,这类核心区人类人类DNA组遗传核心参与进来了腐蚀物应激性状态和对抗逆性氧的海洋生物制品意义工作,是肾结石产生原则中至关非常关键的方式,这反映丁酸机会在肾结石中切实起着非常关键效用。

图1| 丁酸结构类型与靶表观遗传数据网络阐述(图源:Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进一次科学探索丁酸对CaOx肾结石确实切靶什么是dna组组,探讨人工成本回收利用GEO数剧库对GSE73680中良好较与CaOx肾结石自身的什么是dna组组差别的来对其确定了探讨。较组与CaOx结石自身的有明显性能差别的形容什么是dna组组(DEGs)检测细则为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共建立到3783个什么是dna组组情况有明显不良影响,中间3379个(89.4%)什么是dna组组形容上涨,404个(10.6%)什么是dna组组形容调整(图2A)。对DEGs来对其确定聚类分析法算法概述,热图展示了前10个被选中DEGs的二维分层次聚类分析法算法显著特点(图2B)。随后不久,探讨人工成本使用GeneCards数剧库人工成本评定了370个可能与CaOx肾结石有关的内容的什么是dna组组,排民前20位的分析预测什么是dna组组基本有关的内容性得分如同2C提示。至关重要在于查到丁酸治疗方法CaOx肾结石的至关重要靶点,探讨人工成本将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石有关的内容什么是dna组组处理能够 了个Venn图。最中,CYP2C9被选择为丁酸不良影响CaOx肾结石的隐藏的靶点(图2D)。还有就是,探讨人工成本还来对其确定了丁酸与CYP2C9的分子结构无缝对接,CYP2C9的多个氨基酸等残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸彼此之间的作用,氢键能为4.2 kcal/mol(图2E)。 在利于微信网络药剂学学予测CYP2C9是丁酸的影响CaOx肾结石的靶DNA后,研究分析人工还使用癌体细胞實驗断定了CYP2C9可下降草酸促进的HK-2癌体细胞的ROS水准、感染挤压伤和凋亡。

图2| 越多越据库联席进行分析预估CYP2C9是丁酸的作用于CaOx肾结石的靶基因组

探析结果显示

本调查第一出现丁酸在身体之外和体里均能调节CaOx肾结石型号的脱色应激性反应和支原体感染磨损,后来实现电脑在线药剂学学建立拥有丁酸作用CaOx肾结石的未知靶点——CYP2C9,后来实现人体上皮细胞调查阐明CYP2C9在草酸盐引发的HK-2人体上皮细胞ROS的水平、支原体感染磨损和凋亡。那些出现阐明丁酸将会实现调节CYP2C9来调节CaOx肾结石的脱色应激性反应,降低支原体感染磨损。相应时中拜谱怪物具备了电脑在线药剂学学新技术工艺安全服务管理,最后拜谱怪物可加快比较成熟健全完善的基因组组学、核蛋白组学、分解组学等两组学商品及新技术工艺安全服务管理,祝贺垂询质询! 决定性医学文献:Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.
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