
近日,武汉医学院校生首要其他机构王学浩院士评选开发团队在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,球蛋白互作组和靶向治疗电量新陈代谢检测分析服务。
英文音标题目:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
汉语文章标题:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
企业客户机关单位:南京医科大学
调查产品:细胞
拜谱提供了安全服务:转录组测序+球蛋白互作组+靶点体力代谢转化组
科技规划:
研究方案的结果
01、YBX1被签别为HCC中糖酵解的关键点基因组
本实验报告采摘HCC癌症模本(n=7)的单神经元系RNA测序的数据剖析集确认剖析,挖掘糖酵解可溶性重点集合在癌症神经元系中,hdWGCNA剖析快速精确出9个表观遗传模块图片(图1A-G)。TCGA-LIHC链表的能剖析确认YBX1为经济独立能安全隐患各种因素(图1H)。进那步依照IHC、WB实验报告和癌症企业开展与临近非癌症企业开展的三维空间转录组学的数据剖析集证明YBX1是肝神经元系癌手术治疗的存在靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被判别为转换HCC神经元糖酵解的主要缘由
02、YBX1驱动HCC中的有氧糖酵解和增值
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶向药物卡路里分解代谢组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1使得HCC中的有氧糖酵解和分裂繁殖
03、OGT与YBX1依照并增进YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,淀粉酶互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1搭配并提高网站YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化增强学习其磷碱化,因而增强其核转位
进一歩测试YBX1的O-GlcNAc糖基化是否能够导致其磷硝化作用,在OGT敲低的HCC体细胞系中或用OGT抑制作用剂OSMI-1加工,YBX1血清关卡有明显较低,YBX1磷硝化作用有明显提高(图4A-C)。IP实验报告呈现,在雷同的Flag-YBX1底物关卡下,YBX1-WT的磷硝化作用关卡有明显少于YBX1-T57A,是正因为磷硝化作用的曾加这并不仅仅是是正因为高些的YBX1血清表达出来出(图4D)。剥离 了核和质酚类化合物出现 了TMG加工的HCC体细胞系中YBX1核表达出来出的增高(图4E-F),进一歩出现 了YBX1磷硝化作用的最为关键的调结成分是AKT(图4G-I)。许多出现 了更加注重O-GlcNAc糖基化经由催进其磷硝化作用来改善YBX1血清固确定并催进核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 淡化有助于于其进一歩发生磷碱化淡化并可增强其核转位
05、YBX1力促PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1增进PKM2转录
06、YBX1 都可以提高自己组血清乳碱化遮盖关卡
探讨发展YBX1敲低偏态减轻血清酶质乳硝化成用,尤其要是H3K18乳硝化成用(图6A-C)。糖酵解抑止剂2-DG的实验英文确认了糖酵解与组血清酶乳硝化成用的会相关联,抑止糖酵解可偏态减轻H3K18la横向(图6D)。PKM2过表现不可逆转转YBX1敲低伴发的H3K18la增涨,到外源乳酸治理并不是优化H3K18la,还随着YBX1表现调涨,温馨提示具有正面跟进(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR确认,H3K18la采用丰度于YBX1通电子会促进会其转录,该历程受O-GlcNAc糖基化政策调控(图6H-J),高并发展P300 调涨是YBX1减弱H3K18乳酰化成用的制度(图6K-L)。
图6.YBX1改善H3K18乳碱化淡化能力
小文章工作小结
在这些钻研中新闻稿件了YBX1在HCC中高抒发,关键在于与糖酵解谜切一些。YBX1在T57处被O-GlcNAc突显,关键在于动态平衡蛋清质并增进其抒发。这类突显还提高网站YBX1在T57处的磷碱化,提高网站其核易位。因为,某一过程中增进了糖酵解一些人类基因遗传的转录并热血乳酸的形成。于此,YBX1激话P300的转录,因此驱程组蛋清的乳碱化,特别的是H3K18la,H3K18乳碱化正在向调空YBX1人类基因遗传转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观显性基因正反两面馈环制度图
拜谱工作小结
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱怪物为该研究提供了转录组测序,血清互作组和靶向药物能量消耗分解组技术服务,拜谱生物工程建立了完善成熟的转录组学、蛋白酶组学、翻译英语后修饰语组学、消化吸收组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
参考价值论文文献
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.