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新贵顶流“棕榈酰化”项目文章| Mol Cancer(IF27.7)棕榈酰化调控肝癌发生发展

发布时间:2024-12-26

肝癌(Hepatocellular carcinoma, HCC)是全球范围内致死率极高的恶性肿瘤之一。其复杂的病理生理机制和有限的诊断治疗手段使得HCC的治疗成效不佳,预后不良。近年来,蛋白质棕榈酰化修饰作为一种重要的翻译后修饰,被证实与多种生理过程及疾病的发生发展密切相关。S-棕榈酰化是脂酰化的最主要的业务类型,是以16碳碳水化合物酸按照硫酯键与半胱氨酸巯基对接,故而决定淀粉酶质的结构的、定位系统、稳定量分析性、旺盛期、车辆各类调低膜肾上腺素受体、阳离子通路等疾病生理性时的能力。在哺乳动物细胞中,S-棕榈酰化是由23个锌指天冬氨酸-组氨酸-组氨酸-半胱氨酸(ZDHHC)蛋白酰基转移酶(PATs)家族介导的。越来越多的研究表明,S-棕榈酰化的变化与肿瘤密切相关,但其在HCC中的作用尚不完全清楚。

2024年12月19日四川高中癌症醫院徐波团队合作合作和复旦生高中肖有时候团队合作合作在Molecular Cancer期刊杂志(IF:27.7)上发表了题为“ZDHHC20 mediated S-palmitoylation of fatty acid synthase (FASN) promotes hepatocarcinogenesis”的研究文章,研究了棕榈酰基转移酶ZDHHC20在肝癌发生发展中的作用机制。研究发现,ZDHHC20通过在脂肪酸合成酶(FASN)的特定半胱氨酸残基上催化S-棕榈酰化,从而稳定FASN蛋白,抑制其泛素-蛋白酶体途径介导的降解。ZDHHC20缺失或抑制,以及FASN关键半胱氨酸位点的突变,均可加速FASN的降解,抑制肝癌发生发展。这一研究过程中,拜谱动物提供了了棕榈酰化装饰氨基酸质组学能力服务的,电子助力小说家选择ZDHHC20调整的FASN上的重要性性装饰位点,对综合论述技术成果达到画龙点晴的。

的文章名号:ZDHHC20 mediated S-palmitoylation of fatty acid synthase (FASN) promotes hepatocarcinogenesis

学术期刊:Molecular Cancer

202几年应响因素:IF=27.7

文章发表准确时间:2024年12月

客人组织:重庆大学肿瘤医院

设计相关材料:小鼠HCC组织

论述方式:棕榈酰基转移酶ZDHHC20在肝癌发生发展中的作用机制

拜谱带来了科技:棕榈酰化修饰蛋白质组学

模式英文图

图1 体系示意向图(图源:Mo, et al., Mol Cancer, 2024)

需求HCC中的差异表明ZDHHC并来确定其对HCC的影响到

在探求性HCC的大分子系统中,设计组织精益求精于ZDHHC家族网队员的用,格外是ZDHHC20。一开始,进行对HPA和TCGA动态数据的深入实际讲解,设计的人员遇到ZDHHC20在HCC中高把你想表达出来,并和它不合格品效果相关内容。为进步探求性一种想象,组织实现了ZDHHC20敲除小鼠建模方法,并分析到在DEN和DEN+CCl4引诱的HCC建模方法中,ZDHHC20敲除有明显拉低了肝良性恶性肿癌的造成率、变少了良性恶性肿癌结节用户,并减偏小良性恶性肿癌结节网套直径,关键因素在于查证了ZDHHC20在HCC造成成长中的关键因素用。

图2 Zdhhc20-/-小鼠在有机化学诱骗的HCC型号中发生的胰腺恶性肿瘤较小。

(图源:Mo, et al., Mol Cancer, 2024)

分享ZDHHC20的棕榈酰化底物和位点

进一步的研究集中于鉴定ZDHHC20的棕榈酰化底物。通过棕榈酰化绘制组学,研究人员发现ZDHHC20敲除导致97种蛋白质的123个半胱氨酸位点的棕榈酰化水平显著降低,其中FASN的棕榈酰化水平下调最为显著。这表明FASN可能是ZDHHC20的主要棕榈酰化底物。生物信息学分析进一步证实ZDHHC20的敲除显著影响脂肪酸代谢通路。通过RT-qPCR技术,研究人员发现ZDHHC20与脂肪酸代谢相关基因的转录表达呈正相关,且ZDHHC20过表达上调这些基因的表达,增加总胆固醇和甘油三酯水平,而沉默则降低其表达和脂质水平。在高脂肪高糖饮食的小鼠模型中,ZDHHC20敲除导致体重增加速度减慢,表明其可能调控脂肪酸代谢促进HCC的发展。

图3 ZDHHC20人类基因敲除后棕榈酰化核蛋白组提升的能力注音。

(图源:Mo, et al., Mol Cancer, 2024)

校验ZDHHC20与FASN的彼此之间用处和棕榈酰化的关联

为了验证ZDHHC20与FASN的相互作用和棕榈酰化关系,研究团队进行了免疫共沉淀和免疫荧光实验,证实了两者在HCC细胞中的相互作用。接着,通过免疫荧光显微镜观察到ZDHHC20和FASN蛋白在HCC细胞中的共定位。此外,进行免疫血细胞共沉淀物-酰基-生物学素交换(IP-ABE)手段检侧到FASN在HCC血细胞中的棕榈酰化。进一步实验显示,ZDHHC20敲低显著降低了FASN的棕榈酰化水平,而ZDHHC20过表达则显著增加了FASN的棕榈酰化信号。综上所述,研究结果表明ZDHHC20与FASN相互作用,并作为FASN的棕榈酰基转移酶。

图4 棕榈酰转至酶ZDHHC20与FASN间接效应并介导FASN棕榈酰化。

(图源:Mo, et al., Mol Cancer, 2024) 利用LC-MS水平,科学研究销售团队在HCC小鼠团体中判断到FASN的棕榈酰化位点,发现了半胱氨酸1464和1874位点的棕榈酰化差异性减小。进而一个脚印的血清质-血清质连通研究分析查证了ZDHHC20与FASN之前的同时互不使用。关键性的是,FASN中的半胱氨酸1471和1881位点在与众不同外来物种中程度保手,有时候设定或交叉变动许多位点会引起FASN的棕榈酰化电磁波差异性减小。

图5 FASN1471和1881半胱氨酸棕榈酰化依靠于ZDHHC20。

(图源:Mo, et al., Mol Cancer, 2024)

研究FASN棕榈酰化对蛋白质调空的的功能意义所在

为探析ZDHHC20介导的FASN棕榈酰化在HCC中的作用效果,探析团对顺利通过2-溴棕榈酸(2-BP)工作组织细胞,发觉FASN的棕榈酰化和球血清质质关卡相关联数消减。泛素-球血清质质酶体路经是FASN的包括吸附路经,而2-BP露出相关联数添加了FASN的泛素化吸附。ZDHHC20过把你想表达出来出来相关联数添加了FASN的球血清质质关卡,而沉默不语则消减其关卡,一同敲低ZDHHC20消减了FASN球血清质质可靠可靠性,经过把你想表达出来出来则添加其可靠可靠性。哪些导致证实ZDHHC20依耐的FASN棕榈酰化前者泛素化遮盖在HCC中具备的竞争关联。

图6 FASN的棕榈酰化及其泛素化掩盖相之间的竞争

(图源:Mo, et al., Mol Cancer, 2024) 只为研究探讨探讨ZDHHC20对FASN淀粉酶化学溶解塑料的干扰,研究探讨探讨销售团队转染了ZDHHC20与SNX8和TRIM28至肝癌组织,察觉ZDHHC20可缓和了SNX8或TRIM28与FASN的配合。进行实验体现 ,棕榈酰化可缓和剂2-BP提升了FASN的化学溶解塑料,而ZDHHC20的过展示可缓和了某种历程。TRIM28的过展示则增长了FASN的泛素化化学溶解塑料。所以说,ZDHHC20介导的FASN淀粉酶棕榈酰化突显能竞争激烈性可缓和SNX8-TRIM28符合物与FASN淀粉酶的主动效果,才能降底FASN淀粉酶的化学溶解塑料,使得肝癌的出现和趋势。

图7 ZDHHC20实现与FASN和SNX8-TRIM28和好体相互之间的相互之间用争夺来增强FASN血清的安全性

(图源:Mo, et al., Mol Cancer, 2024)

确认FASN棕榈酰化位点基因突变对肝癌不良影响

接下来,学习团对探索了FASN核蛋白质酶在半胱氨酸1471和1881位点的棕榈酰化修饰语对其比较稳确定的应响。其察觉到将这好几个位点突变性为丝氨酸需要减低FASN核蛋白质酶的比较稳确定,增強其泛素化分解,并减低肝癌細胞的繁殖力。还有就是,人肝癌组建中ZDHHC20和FASN核蛋白质酶的描述关卡远远超出正常情况下组建,表示ZDHHC20-FASN轴在肝癌的的发生壮大中起着关键点效用,ZDHHC20适用于为肝癌制疗的因素靶点。

图8 阻挡FASN半胱氨酸1471/1881棕榈酰化要加速FASN可降解并可抑制癌肿

(图源:Mo, et al., Mol Cancer, 2024)

工作小结

在这突破性研究中,我们深入了解了HCC中S-棕榈酰化修饰的关键调控者——ZDHHC20。不仅揭示了ZDHHC20在HCC发展中的重要作用,还发现了其通过棕榈酰化修饰稳定FASN的新机制,为肝癌的诊断和治疗提供了新的视角。这一过程中,拜谱生物体为作者带来半胱氨酸-S棕榈酰化淡化球脂肪酸组学的服务,验证了蛋白质棕榈酰化介导HCC的发生发展,为文章最后结论奠定基调起到不可或缺的作用。

拜谱个人心得体会

棕榈酰化是重要的脂质化修饰形式,一般发生在半胱氨酸残基上。棕榈酰化修饰最重要的功能是增强可通行蛋白与膜的亲和性,从而调控蛋白质的定位与功能。拜谱作为国内领先的多组学服务公司,可提供基因组、转录组、蛋白组、代谢组等多组学服务。围绕半胱氨酸防氧化物恢复备份体现,拜谱海洋生物可提供了软件热门面、工艺标准最较为成熟的防氧化物恢复备份体现型号软件,有棕榈酰化、亚硝基化、谷胱甘肽化、硫巯基化、次磺过酸、total氧化的还原故宫场景、散布巯基,促动一系例论文发稿。在这当中棕榈酰化掩盖球胆固醇组也是我司首例创立、我们国家唯一的成熟稳定商用化的隆重标志性品牌,积累了了充实的创业工作经验值,建立了在多种外来物种、多种建模方法、多种阻止中的高效率的排除,棕榈酰化修饰语位点平均值查出量大约20000+,更高已的提升40000+。欢迎大家咨询!

可以参考学术论文:

Mo Y, Han Y, Chen Y, Fu C, Li Q, Liu Z, Xiao M, Xu B. ZDHHC20 mediated S-palmitoylation of fatty acid synthase (FASN) promotes hepatocarcinogenesis. Mol Cancer. 2024 Dec 19;23(1):274. doi: 10.1186/s12943-024-02195-5
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