
2024年9月由长沙绿植基地高中张万刚讲解组织在期刊Journal of Agricultural and Food Chemistry发表题为“Exploring the Effects of S‑Nitrosylation on Caspase‑3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro”文章,研究发现了GSNO处理后caspase-3的活性显著降低(P < 0.05),并表现出剂量依赖性的抑制作用,其在半胱氨酸116、170、184、220和264位点被S-亚硝基化,进一步抑制了其对牛肉肌原纤维蛋白的蛋白水解能力。拜谱生物学为该研究提供了亚硝基化遮盖组学拜谱生物,助力发现目的蛋白上的亚硝基化修饰位点。
中文名字标题格式:体外研究S-亚硝基化对牛肉Caspase-3修饰和肌原纤维降解的影响
刊物:Journal of Agricultural and Food Chemistry
2026年干扰指数:5.7
发表文章时长:2024年9月
朋友行业:南京农业大学
论述产品:蛋白
拜谱展示 技巧:亚硝基化修饰组学
技术工艺路经:
一、探索的结果
01.Caspase-3吸附性
当前尚不很明白NO对caspase-3的治理和改善影响是否有归因于NO介导的S-亚硝基化,的不同氨水浓度均值的GSNO算作外源性NO供应商,以诱惑caspase-3的离体S-亚硝基化。最终结果证实,与沒有GSNO的组相比较,100、200和400μM GSNO组的caspase-3吸附性正相关减低(图1),与原本有关资料相一致。GSNO整理减低caspase-3吸附性的潜在性的其原因仍存在不足指出。
图1 不一含量的GSNO工作对caspase-3亲水性的损害
02.Caspase-3的S-亚硝基化限度
探析Caspase-3的亚硝基化成度,以相相同GSNO对Caspase-3的反映性。经GSNO加工后,检则到caspase-3蛋白质S-亚硝基化效果添加(图2)。等等导致得出结论,外源性GSNO训练可完美诱骗caspase-3的离体S-亚硝基化。使人难以相信的是,在还没有GSNO长期存在的對照组中检则到一款不大的S-亚硝基化带,这得出结论caspase-3几率造成内源性的S-亚硝基化。除外,本探析中caspase-3的S-亚硝基化成度较高,而caspase-3的吸附性降低了,这与此前的探析相同。然后,caspase-3的炎症因子朋友S-亚硝基化绘制位点尚不明白,还要进步的探讨。
图2 GSNO正确处理对caspase-3S-亚硝基化含量的关系
03.Caspase-3的S-亚硝基化位点
通过亚硝基化遮盖组学检测caspase-3的S-亚硝基化位点。结果表明,caspase-3上的4个多肽中有5个半胱氨酸残基被蛋白S-亚硝基化修饰(图3)。亚硝基化半胱氨酸定位于SSFVCVLLSHGEEGIIFGTNGPVDLK,GTELDCGIETDSGVDDDMACHKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWR,DGSWFIQSLCAMLK和KQIPCIVSMLTK的多肽中,分别位于116、170、184、220和264位。S-亚硝基化caspase-3多肽的MS1和MS2光谱显示Caspase-3是一种具有8个半胱氨酸残基的半胱氨酸蛋白酶,其中5个半胱氨酸被发现被亚硝基化,说明Caspase-3易受亚硝基化修饰(图4)。此外,据先前报道casase-3的催化残留亚硝基化Cys163,这不同于本研究的结果。S-亚硝基化caspase-3的丰度、位点的修饰水平和检测方法的灵敏度的差异可能是导致结果不一致的原因之一。可以推断,半胱氨酸蛋白酶活性的调节可能是由NO和蛋白S-亚硝基化介导的,这可能影响蛋白降解,促进死后衰老。
图 3 caspase-3的回文编码序列。蓝图标的回文编码序列提出S-亚硝基化肽,粉红色图标的C提出S-亚硝基化半胱氨酸
图4. s-亚硝基化肽和caspase-3位点的MS1和MS2光谱分析
04.S-亚硝基化Caspase-3化学降解结核蛋白
结淀粉酶质对于一些至关重点的组织骨架淀粉酶质,在恢复肌组织架构的架构详尽性和收拢性因素起着至关重点反应,探究S-亚硝基化caspase-3对结淀粉酶质分解的敏感度性都有着至关重点含义。与Std(未用胱天淀粉酶质酶-3和GSNO孵育的开始肌弹性玻纤淀粉酶质)组对比,0 μM GSNO组(肌原弹性玻纤和caspase-3的孵育,无GSNO)的详尽结淀粉酶质含氧量强势降底,显示系统caspase-3对结淀粉酶质都有着暗藏的淀粉酶质溶解专业能力。在GSNO孵育后,详尽结淀粉酶质的含氧量凸显扩大(P < 0.05)。除此之外,当GSNO渗透压偏高时,详尽结淀粉酶质的含氧量持继上涨(P < 0.05)(图5)。这一项发掘表达,SNO淡化的caspase-3以水平面依赖关系的办法促使结淀粉酶质的分解。
图5.S-亚硝基化caspase-3降解塑料结蛋白质
05.S-亚硝基化Caspase- 3降解塑料肌钙血清-T
肌钙蛋清-T (TnT)是原肌球蛋清调接负责任腿部肌肉缩小的细细的的需要肌原钎维蛋清。TnT的挥发表现是检验工具到28和30 kDa的TnT。在亚硝基化标准下,caspase-3对TnT的挥发状态如下图6所显示,与Std组(不包括caspase-3和GSNO的肌原钎维)不同于,caspase-3组中30 kDa TnT精彩场面描写特殊不断增加,揭示caspase-3参与性了TnT的挥发,还有,caspase-3与GSNO的孵育造成30 kDa TnT走低。在100和200 μM GSNO组彼此未检验工具到强烈的性别差异(P > 0.05),而当GSNO的溶度可达400 μM 时,该精彩场面描写特殊以减少(P < 0.05)。这个发掘揭示了SNO绘制的caspase-3对TnT挥发的调控使用。结蛋清和TnT是caspase-3的过敏底物,而GSNO正确处理较低caspase-3的几丁质酶将会造成肌原钎维蛋清挥发系数较低。与此同时表明,NO引导的S-亚硝基化可以可以通过绘制半胱氨酸残基来调接caspase-3的几丁质酶,以致进第一步不良影响力其对结蛋清和TnT的蛋清电离特性,导致不良影响力牛肉片品行。
图6. S-亚硝基化caspase- 3降解塑料肌钙球蛋白-T
二、总结ppt
本研发旨在通过浅谈S-亚硝基化对caspase-3呈现的后果还有随即对羊肉肌原合成纤维材料休外光降解的后果。蛋清酶酶S-亚硝基化能能呈现caspase-3的半胱氨酸残基,因此诱发caspase-3活力性降低,更加骤治理和改善了其对羊肉肌原合成纤维材料蛋清酶酶的蛋清酶酶蛋白质水解的能力。三、拜谱个人心得体会
钻研适用了酶活测定法,亚硝基化体现组学研究探讨分析,WB等监测的方法,发现血清S-亚硝基化可体现caspase-3的半胱氨酸残基,这形成了caspase-3亲水性的下降,相结1步限制了其对牛羊肉肌原植物纤维血清的血清电离性能。本钻研为释意血清质亚硝基化对肉嫩的国家宏观调控规则供应了一大个新的移动镜头。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司,可提供完善成熟的血清酶质组学、遮盖血清酶质组学、产生组学、转录组学等多组学产品技术服务体系,整合多组学数据进行深入挖掘分析,全面解析机制机理等,助力高分文章发表。除此之外,拜谱生物还可提供半胱氨酸系例服务,包括亚硝基化、谷胱甘肽化、硫巯基化、次磺酸性反应、total氧化反应重置、悬浮巯基,欢迎大家咨询!
参考使用期刊论文:
Qin Hou, Chao Ma, Rui Liu, Zhuangli Kang, and Wangang Zhang.Exploring the Effects of S-Nitrosylation on Caspase-3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro. Journal of Agricultural and Food Chemistry. doi.org/10.1021/acs.jafc.4c06663